高性能计算系统(HPC)

仪器简介


本集群计算节点基于英特尔®至强®可扩展家族处理器平台构建,共包含计算节点46个,每节点配置2颗20核心2.3GHz主频的x86中央处理器,并配合8根3200MT/s DDR4内存条,总双精度峰值计算能力为每秒194.6万亿次。此外,集群配置有完整、高效、专业的基础软件,如Gaussian、AMBER、Gromacs、RStudio Server等,支持CPU和GPU加速卡的多种编译环境及应用。使用先进计算平台实现集群监控管理和作业调度功能,实现资源的统一调度与管理,并具有自动计费、余额查询、机时统计等功能。提升集群使用的灵活性和利用效率,为用户提供高速的大规模运算和数据分析能力。

主要功能

FUNCTION

1、生命科学:药物发现和设计;蛋白分子动力学模拟;量子化学计算;深度学习等。

2、医疗保健:慢病管理与疾病监测;影像辅助诊断;大规模数据集分析和挖掘等。

3、基因组学:基因组测序及分析;基因功能注释;生物信息学等。

4、工程设计:工程模拟与优化;人工智能与物理仿真等。

5、气象环境:天气预报;自然灾害预测;石油勘探等。



应用案例

APPLICATION


基于MD模拟的配体-蛋白结合模式探究




碳谱、ECD计算确定天然产物相对构型、绝对构型




QM/MM模拟酶催化反应过程能量变化



原发性胆汁性胆管炎患者PBMC单细胞转录组谱(10.1038/s41467-024-53104-9.)


仪器技术支撑性人才


龙亮,博士,蛋白科学区计算中心负责人,负责高性能计算集群常规功能的技术指导、新功能的开发以及日常管理和维护等工作。承担本功能区对接研究平台事务性工作任务。


教育科研经历

广州中医药大学         技术支撑性人才

暨南大学/药学院              博士

中山大学/药学院              硕士

中国药科大学/药学院        学士


围绕抗肿瘤药物蛋白靶点的分子动力学性质、抑制剂虚拟筛选及蛋白-配体相互作用机制研究,具备CADD、MD模拟、DFT计算等研究背景。熟练操作AMBER、Gaussian、薛定谔、MOE等计算相关软件。以第一作者在Nat. Commun.,Sci. Adv.,Eur. J. Med. Chem.等期刊发表SCI论文 10 余篇,已授权专利 2 项。

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