作者: admin

  • 高性能计算系统(HPC)

    高性能计算系统(HPC)

    仪器简介


    本集群计算节点基于英特尔®至强®可扩展家族处理器平台构建,共包含计算节点46个,每节点配置2颗20核心2.3GHz主频的x86中央处理器,并配合8根3200MT/s DDR4内存条,总双精度峰值计算能力为每秒194.6万亿次。此外,集群配置有完整、高效、专业的基础软件,如Gaussian、AMBER、Gromacs、RStudio Server等,支持CPU和GPU加速卡的多种编译环境及应用。

    使用先进计算平台实现集群监控管理和作业调度功能,实现资源的统一调度与管理,并具有自动计费、余额查询、机时统计等功能。提升集群使用的灵活性和利用效率,为用户提供高速的大规模运算和数据分析能力。


    主要功能

    FUNCTION

    1、生命科学:药物发现和设计;蛋白分子动力学模拟;量子化学计算;深度学习等。

    2、医疗保健:慢病管理与疾病监测;影像辅助诊断;大规模数据集分析和挖掘等。

    3、基因组学:基因组测序及分析;基因功能注释;生物信息学等。

    4、工程设计:工程模拟与优化;人工智能与物理仿真等。

    5、气象环境:天气预报;自然灾害预测;石油勘探等。



    应用案例

    APPLICATION


    基于MD模拟研究配体-蛋白结合模式


     碳谱、ECD计算确定天然产物相对构型、绝对构型


    QM/MM模拟酶催化反应过程能量变化


     

    原发性胆汁性胆管炎患者PBMC单细胞转录组谱

    (doi: 10.1038/s41467-024-53104-9.)


    仪器技术支撑性人才


    龙亮,博士,蛋白科学区计算中心负责人,负责高性能计算集群常规功能的技术指导、新功能的开发以及日常管理和维护等工作。承担本功能区对接研究平台事务性工作任务。


    教育科研经历

    广州中医药大学       技术支撑性人才

    暨南大学/药学院            博士

    中山大学/药学院            硕士

    中国药科大学/药学院      学士


    围绕抗肿瘤药物蛋白靶点的分子动力学性质、抑制剂虚拟筛选及蛋白-配体相互作用机制研究,具备CADD、MD模拟、DFT计算等研究背景。熟练操作AMBER、Gaussian、薛定谔、MOE等计算相关软件。在Nat. Commun.,Sci. Adv.,Eur. J. Med. Chem.等期刊发表SCI论文10余篇,已授权专利 2 项。


  • 高分辨荧光标测系统

    高分辨荧光标测系统

    仪器简介


    品牌:Mapping Lab
    型号:OMS-PCIE-2002

    荧光标测技术是通过在心肌组织上装载荧光染料,通过高速相机记录荧光变化来反应心脏组织中电压或者各种离子浓度的变化。它可以同步记录动作电位与钙信号,具有高时空高分辨率,该技术适用于多种可兴奋组织和细胞,例如:体外心脏、活体心脏、心脏切片,新鲜分离的心肌细胞和干细胞分化的心肌细胞、神经、胃肠平滑肌等。


    主要功能

    FUNCTION

    1、研究各种心脏疾病,心律失常机理;

    2、药物心脏安全性评价;
    3、新药研发。


    应用案例

    APPLICATION



    心率失常过程发生视频  

    仪器技术支撑性人才

    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。

  • 全息旋转扫描活细胞CT系统

    全息旋转扫描活细胞CT系统

    仪器简介


    品牌:Nanolive
    型号:CX-A

    CX-A(即3D Cell Explorer 96focus)活细胞CT系统通过多角度衍射场断层扫描技术,实现高速、高分辨率、无标记、非侵入式的活细胞成像,可无损伤研究细胞3D结构,获取从3D形态到分子层的完整细胞信息。将细胞样本放入设备后,CX-A将执行连续旋转扫描,软件在2秒钟内以3D形式在计算机上显示细胞。


    主要功能

    FUNCTION

    1、用于肿瘤学、免疫学、细胞生物学、神经科学、干细胞研究、微生物学、血液学及组织学等无标记、无损伤的细胞3D内部结构细胞核、细胞膜、核仁及亚细胞结构如线粒体、高尔基体、微囊泡、脂质体等3D结构研究。

    2、细胞生长、凋亡、周期分析,荧光标记分子共定位、GFP转染分析及实时追踪等。


    应用案例

    APPLICATION

    脂滴          线粒体        溶酶体

    仪器技术支撑性人才

    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。

  • 高通量单细胞、器官功能测量及纳米水凝胶3D培养系统

    高通量单细胞、器官功能测量及纳米水凝胶3D培养系统

    仪器简介


    品牌:PLEXITHERMO
    型号: HCells-1F

    作为一种非破坏性,非侵入性的细胞检测平台,它可以对多个细胞进行快速成像,同时可得到细胞的收缩力、钙瞬变、收缩速度、细胞大小、面积、实际功率,收缩角度、速度差和力差等大量数据。所搭载的纳米水凝胶的可调控基底硬度,对培养的心肌细胞进行催熟并促进分化以适应不同的研究需求。此外,该平台支持宏观尺度下的功能检测,包括各种组织、斑马鱼模型等。


    主要功能

    FUNCTION

    1、它可以检测和量化亚微米级的细胞运动,使研究人员能够可视化和分析靶细胞与靶细胞大小和时间间隔的精细运动。

    2、同时测量细胞力学和离子通道等指标。测试对象范围广泛,从单细胞和组织到斑马鱼模型。


    应用案例

    APPLICATION


    大鼠心肌细胞钙火花

    仪器技术支撑性人才

    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。

  • 正置/倒置激光共聚焦显微镜

    正置/倒置激光共聚焦显微镜

    仪器简介


    品牌:Olympus    型号:FV3000

    应用于基础医学、发育生物学、遗传学、毒理学、药理学、分子生物学等科研领域。适用于组织切片、细胞爬片、活细胞动态观察等研究。


    主要功能

    FUNCTION

    1、多通道点扫描共聚焦荧光成像、明场成像、DIC成像

    2、三维Z轴扫描拍摄、大视野拼图
    3、光操纵


    应用案例

    APPLICATION

    仪器技术支撑性人才


    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。

  • 微循环检测系统(微血管超显微成像系统)

    微循环检测系统(微血管超显微成像系统)

    仪器简介


    品牌:OPTOPROBE
    型号: Micro-VCC

    血管微循环活体监测系统是一种能以微米分辨率无创获取生物组织微血管形态的三维可视化的成像技术,该系统具有很高的空间分辨率,能观察到单根毛细血管,如活体大脑微血管、视网膜微血管、肿瘤周围处微血管、皮肤微血管、心脏微血管等都可以得到较高分辨率的高清3D成像。设备无需特殊标记,非接触性检测,超广角视野范围,超高速的扫描,都使得更好、更快的获得组织的高清三维微血管结构成像。

    主要功能

    FUNCTION

    可进行多种动物样本组织检测,如啮齿类动物、鸡、斑马鱼、兔子等动物胚胎、皮肤、心血管、脑组织等。


    应用案例

    APPLICATION

    小鼠胃组织血管成像


    小鼠肠组织血管面积、复杂度、流速计算图

    仪器技术支撑性人才

    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。

  • 高通量GPCR及离子通道分析系统

    高通量GPCR及离子通道分析系统

    仪器简介


    品牌:Molecular Devices
    型号: FLIPR Penta

    FLIPR 是高通量CCD荧光检测分析系统,适合于生命科学研究和高通量药物筛选,例如分子生物学、植物学、遗传学、动物学、微生物学、病理学与病理生理学等学科研究中。特别是在药物筛选中GPCR的钙流检测中,可定量检测细胞内的钙流。钙流检测是生物学中一个重要的检测指标,更是越来越被广泛应用于化合物筛选和安全性评价中。


    主要功能

    FUNCTION

    1、可用于观察与离子通道激活和离子转运蛋白相关的实时膜电位变化。

    2、可观察钙离子通道,以评估药物发现早期阶段的心脏毒性。
    3、可测量配体和电压门控钾通道的功能活性。
    4、用于检测3D心肌细胞和神经元中的钙振荡,提供具有生物相关性的检测系统以评估潜在的新药物治疗和环境毒素。



    应用案例

    APPLICATION

    测量钾离子通道的功能活性


    观察实时膜电位变化


    细胞和组织内钙流信号评估


    药物毒性评估

    仪器技术支撑性人才


    胡明丽,博士,高分辨成像区支撑性人才,负责共聚焦成像、高通量筛选、微血管成像等设备的培训、维护及新技术开发,积极对接校内外的科研需求,促进资源共享。


    教育科研经历

    广州中医药大学     技术支撑性人才

    中科院广州生物医药与健康研究院     博士后

    中国科学院生物物理研究所     博   士



    长期从事表观遗传与细胞命运调控的研究。围绕表观遗传调控与自闭症发生机制进行研究,利用高分辨荧光成像及透射电镜成像等生物物理方法揭示了自闭症的发病机制。此外,进行了表观遗传调控与细胞命运转变的研究,熟练掌握了细胞编辑、组织切片染色、蛋白纯化、相分离等技术方法。主持国自然青年基金项目、广东省面上项目等基金5项,以第一作者发表Cell Research(IF=28.1)研究论文,另外参与发表论文8篇,获授权专利 1项。

  • 气相色谱-质谱联用仪

    气相色谱-质谱联用仪

    仪器简介


    品牌:Agilent          

    型号:8890-5977C


    Agilent 8890-5977C是环境杂质和食品测试、化工与石化分析以及法医学和药物化合物分析的常规、可靠的主力仪器。检测限低至 1 fg IDL。主要应用于常见的挥发或半挥发性有机化合物定性与定量分析,如有机溶剂残留的测定,天然产物的结构研究,农残、兽残、药残分析等。

    仪器技术支撑性人才


    林美卿,博士,主要负责平台成像质谱区和色谱质谱区仪器设备的运行、技术开发、维护和培训等。包括空间定位组学系统、DESI/MALDI集成空间成像质谱仪、超高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪、超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪和超高效液相色谱-四级杆离子阱串联质谱仪。

  • 超高效液相色谱-质谱联用仪

    超高效液相色谱-质谱联用仪

    仪器简介


    品牌:Agilent          

    型号:1290 Infinity II-6546          


    超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪。6546 具备出色的灵敏度、动态范围、分辨率、同位素保真度和精确质量测量,所得高质量数据可为快速、简化的数据审查流程提供满足需求的可信度,是代谢组学研究的理想平台;采用Q-RAI(四极杆分辨全离子)或全离子采集功能后,可执行目标物和疑似物的同步筛查。主要应用于中药复方中的有效成分筛查;鉴定复杂混合物中的疑似物、目标物和未知化合物;复杂生物基质中内源代谢物,代谢组学研究等。



    品牌:AB Sciex

    型号:QTRAP 7500


    超高液相色谱-四级杆离子阱串联质谱仪。SCIEX Triple Quad™ 7500 系统是所有SCIEX质谱系统中灵敏度高的产品。此系统配备OptiFlow™ Pro离子源和D Jet™离子导向技术,可以定量发现您研究项目中遇到的非常复杂、粗糙样品中的极低水平的目标物,线性动态范围达到6个数据级的定量能力可以简化您的实验流程。主要应用于复杂生物基质样品中化合物的超高灵敏度检测;高通量靶向脂质类、多肽类、激素类等化合物定性定量分析。



    品牌:Agilent

    型号:1290 Infinity II-6495C


    超高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪。6495C三重四极杆液质联用系统是一款超高性能系统,专为研究和检测实验室的大批量样品分析而设计。该LC/MS/MS配备第三代iFunnel技术,对复杂基质中挑战性的分析物(例如组学、食品和环境分析)实现了 ppt 级检出限,同时可提供亚毫秒级驻留时间下的高精度结果。主要应用于复杂生物基质样品中小分子化合物,如药物及其代谢产物、内源性小分子等化合物定性定量分析;药物入血/入靶的有效成分定性定量分析。

    仪器技术支撑性人才


    林美卿,博士,主要负责平台成像质谱区和色谱质谱区仪器设备的运行、技术开发、维护和培训等。包括空间定位组学系统、DESI/MALDI集成空间成像质谱仪、超高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪、超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪和超高效液相色谱-四级杆离子阱串联质谱仪。


    教育科研经历

    广州中医药大学     技术支撑性人才
    广东工业大学       博士后
    中国科学院广州地球化学研究所    博士

    拥有10年以上各项质谱仪使用、管理、维护、培训经验。专注人体生物样品中痕量活性代谢产物的筛查与识别,相关技术应用于阐明药代毒代动力学特征,鉴定关键特征生物标志物。主持国自然青年科学基金项目1项,参与国自然面上项目、重点研发项目等10余项,发表SCI论文20余篇,授权专利2项。
  • LSM900激光扫描共聚焦显微镜

    LSM900激光扫描共聚焦显微镜

    仪器简介


    品牌:Zeiss      

    型号:LSM 980


    LSM 900是新一代激光扫描共聚焦显微镜系统,具有成像分辨率高、检测灵敏度好的特点。LSM 900不仅具有优异的激光共聚焦显微镜性能,而且可以实现超高分辨率成像等不同的功能以满足多种不同样品的实验需求。其应用包括观察细胞器结构和分布变化,药物进入细胞的动态过程、定位分布及定量分析等,内脏组织相关的各种疾病病理性的研究等。


    功能与应用:多通道点扫描共聚焦荧光成像、明场成像、DIC成像、三维Z轴扫描拍摄、大视野拼图、光操纵

    仪器技术支撑性人才


    詹秀丹,博士,目前负责平台高分辨成像与电生理区脉冲激光联动显微镜、高内涵成像系统、活细胞3D超高分辨率显微系统、LSM900激光扫描共聚焦显微镜、多维高分辨快速全景成像定量分析系统等仪器的维护和培训工作。