广州中医药大学科技创新中心

分类： 蛋白质科学区

  • 高性能计算系统（HPC）

    高性能计算系统（HPC）

    仪器简介


    本集群计算节点基于英特尔®至强®可扩展家族处理器平台构建，共包含计算节点46个，每节点配置2颗20核心2.3GHz主频的x86中央处理器，并配合8根3200MT/s DDR4内存条，总双精度峰值计算能力为每秒194.6万亿次。此外，集群配置有完整、高效、专业的基础软件，如Gaussian、AMBER、Gromacs、RStudio Server等，支持CPU和GPU加速卡的多种编译环境及应用。使用先进计算平台实现集群监控管理和作业调度功能，实现资源的统一调度与管理，并具有自动计费、余额查询、机时统计等功能。提升集群使用的灵活性和利用效率，为用户提供高速的大规模运算和数据分析能力。

    主要功能

    FUNCTION

    1、生命科学：药物发现和设计；蛋白分子动力学模拟；量子化学计算；深度学习等。

    2、医疗保健：慢病管理与疾病监测；影像辅助诊断；大规模数据集分析和挖掘等。

    3、基因组学：基因组测序及分析；基因功能注释；生物信息学等。

    4、工程设计：工程模拟与优化；人工智能与物理仿真等。

    5、气象环境：天气预报；自然灾害预测；石油勘探等。



    应用案例

    APPLICATION


    基于MD模拟的配体-蛋白结合模式探究




    碳谱、ECD计算确定天然产物相对构型、绝对构型




    QM/MM模拟酶催化反应过程能量变化



    原发性胆汁性胆管炎患者PBMC单细胞转录组谱（10.1038/s41467-024-53104-9.）


    仪器技术支撑性人才


    龙亮，博士，蛋白科学区计算中心负责人，负责高性能计算集群常规功能的技术指导、新功能的开发以及日常管理和维护等工作。承担本功能区对接研究平台事务性工作任务。


    教育科研经历

    广州中医药大学         技术支撑性人才

    暨南大学/药学院              博士

    中山大学/药学院              硕士

    中国药科大学/药学院        学士


    围绕抗肿瘤药物蛋白靶点的分子动力学性质、抑制剂虚拟筛选及蛋白-配体相互作用机制研究，具备CADD、MD模拟、DFT计算等研究背景。熟练操作AMBER、Gaussian、薛定谔、MOE等计算相关软件。以第一作者在Nat. Commun.，Sci. Adv.，Eur. J. Med. Chem.等期刊发表SCI论文 10 余篇，已授权专利 2 项。

  • 超声波细胞破碎仪

    超声波细胞破碎仪

    仪器简介


    JP-ESC系列超声波破碎仪是一种利用超声波在液体中产生空化效应的多功能、多用途仪器。配备了3mm、6mm、15mm、20mm直径变幅杆，满足多种样品处理量和破碎功率的需求。


    主要功能

    FUNCTION

    1、多种动植物、病毒、细胞、细菌及组织的破碎；

    2、乳化、分立、匀化、提取、消泡、清晰、纳米材料的制备、分散及加速化学反应等实验。

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 非接触式超声破碎仪

    非接触式超声破碎仪

    仪器简介


    BioruptorPico 是一种能够剪切核酸样本从 100 bp 至 1 kb 的一体式剪切系统。用户可灵活选择样本体积(20 µL – 2 mL) 和快速平行处理样本（最多可同时处理 16 个样本）。配置冷却系统可准确控制温度。


    主要功能

    FUNCTION

    1、适用于各种生物样本的剪切处理，如二代测序样本DNA片段化、染色质、RNA剪切、从组织和细胞中提取蛋白质，用于免疫共沉淀实验、蛋白质聚集研究、蛋白质质谱分析等；

    2、应用于环境研究、毒理学、基因组学、表观基因组学、癌症研究、干细胞和发育、神经科学、临床应用等领域‌‌。

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 多功能酶标仪

    多功能酶标仪

    仪器简介


    BioTek Synergy H1系列的SH1MF是一款模块化多功能微孔板检测仪，其配备光栅光学系统和滤光片光学系统，可用于荧光和发光检测以及无滤光片紫外-可见吸收光检测。SH1MF可提供连续的带宽可调光栅，用于荧光激发和发射波长的选择，带宽可设置在 9 nm 到 50 nm 之间，步进为 1 nm。

    主要功能

    FUNCTION

    1、检测功能：紫外/可见吸收光检测、荧光和发光检测、时间分辨荧光、荧光偏振、BRET、TR-FRET等；

    2、核酸、蛋白定量和纯度检测，酶活力测定，GPCR与离子通道检测，细胞活力检测，细胞增殖、侵袭检测，微生物生长曲线测定，内毒素检测，胞内/外ROS测定，ATP检测，蛋白分子互作等。

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 快速异戊二烯传感器

    快速异戊二烯传感器

    仪器简介


    Hills快速异戊二烯传感器采用串行通信控制的光学检测系统，可提供连续的异戊二烯监测，可对大气研究中小于 1 ppb 、生物和医学研究中的ppm 水平的异戊二烯进行连续监测。自定义软件可控制光子计数，实时显示化学发光信号和异戊二烯浓度（ppb），并将数据存档。FIS 信号在所有典型测量区域（4 个数量级浓度范围）内呈线性，允许进行简单的数据解释和单点或两点校准。

    主要功能

    FUNCTION

    1、大气研究；植物生理学研究；人体生理学研究；

    2、工业异戊二烯监测；
    3、异戊二烯生物合成；
    4、异戊二烯呼吸器。



    应用案例

    APPLICATION

    转基因对亚麻荠异戊二烯排放的影响

    （ Xi et al. , Planta, 2016.）


    微藻和大型藻类中异戊二烯的生产速率检测

    （Exton et al., Limnol. Oceanogr.: Methods 8, 2010 .）

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 全自动微波多肽合成仪

    全自动微波多肽合成仪

    仪器简介


    BiotageInitiator+ Alstra是一款全自动单通道微波多肽合成仪，通过微波辅助技术，可显著缩短反应时间，提高粗产物的纯度与产率，可用于小规模和大规模的多肽、类蛋白胨、PNA和拟肽物的合成。在大型触摸屏上具有直观的用户界面，固相多肽合成和有机化学合成两种工作模式可手动切换。

    主要功能

    FUNCTION

    1、适用于多肽药物开发、类肽及拟肽的小试合成和克级制备；

    2、支持Fmoc和Boc固相合成法，可完成支链多肽等复杂多肽的合成。


    应用案例

    APPLICATION

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 高分辨离子淌度蛋白分析系统

    高分辨离子淌度蛋白分析系统

    仪器简介


    timsTOF Pro 2 在不同的离子淌度分辨率下具有全范围的高分辨和高灵敏度，可实现近乎 100% 的离子利用率，大大降低样品分析复杂度，极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性，只需要少量样本即可达到组学鉴定新深度。

    主要功能

    FUNCTION

    1、多组学分析：蛋白质组学分析、代谢组学分析、脂质组学分析；

    2、化合物分子式确认和未知物分子式推断，目标化合物和未知物
        的筛选、定量、确证。



    应用案例

    APPLICATION

    1.中药单体/复方成分鉴定；

    2. 中药入血/入靶的有效成分定性定量分析；

    3. 中医药防病治病的作用机制研究。



     

    仪器技术支撑性人才

    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。

  • 高通量多功能微孔板读板仪

    高通量多功能微孔板读板仪

    仪器简介


    SpectraMax iD5 高通量多功能微孔读板机具有光吸收、荧光、化学发光、时间分辨荧光 (TRF)，荧光偏振等检测功能。iD5 创新性地实现了高灵活性和高灵敏度的精确结合，主机内置光栅和滤光片双光路系统，可随意组合进行检测优化。采用新型-5 ℃制冷检测器，降低背景噪音，提高信噪比。


    主要功能

    FUNCTION

    1、支持吸光度-荧光和发光检测、时间分辨荧光、荧光偏振等；

    2、DNA，RNA及蛋白定量和纯度检测、ELISAs/酶学动力学检测、离子通道检测、药物分解实验、细胞活力、细胞毒性、细胞增殖检测、Caspase-3/7和蛋白酶检测、CatchPoint cAMP检测、受体-配体结合、药物靶点研究等。

    仪器技术支撑性人才


    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。


    教育科研经历

    广州中医药大学   技术支撑性人才

    美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校   访问学者

    华南农业大学生命科学学院    博士


    长期从事细菌脂肪酸及其衍生物合成代谢研究，通过分子遗传学与蛋白质功能研究手段，系统阐明细菌脂肪酸代谢通路关键蛋白的功能研究和致病机制。具备覆盖载体构建、细菌突变株构建与表型验证、蛋白质可溶性表达优化、代谢产物合成优化的分子生物学和合成生物学技术体系。获得省人才国际培养计划1项，参与国家自然科学基金项目和省市级项目4项，发表论文8篇。

  • 台式玻璃生物反应器

    台式玻璃生物反应器

    仪器简介


    Eppendorf BioFlo120生物反应器兼容各种可高压灭菌玻璃和BioBLU一次性生物反应器，敏感的哺乳动物细胞以及高需求的微生物培养物可以在单个控制器上处理。


    主要功能

    FUNCTION

    1、细胞培养：用于培养微生物、植物细胞、动物细胞和干细胞，支持细胞增殖和代谢研究；

    2、发酵过程：适用于酵母、细菌和真菌的发酵研究，优化生产条件以提高产率；
    3、蛋白表达：在重组蛋白的表达和纯化过程中，提供理想的培养环境； 
    4、生物反应研究：用于研究和优化生物反应条件，如pH、温度、溶氧等。

    仪器技术支撑性人才


    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。


    教育科研经历

    广州中医药大学   技术支撑性人才

    美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校   访问学者

    华南农业大学生命科学学院    博士


    长期从事细菌脂肪酸及其衍生物合成代谢研究，通过分子遗传学与蛋白质功能研究手段，系统阐明细菌脂肪酸代谢通路关键蛋白的功能研究和致病机制。具备覆盖载体构建、细菌突变株构建与表型验证、蛋白质可溶性表达优化、代谢产物合成优化的分子生物学和合成生物学技术体系。获得省人才国际培养计划1项，参与国家自然科学基金项目和省市级项目4项，发表论文8篇。

  • 低温超高压细胞破碎仪

    低温超高压细胞破碎仪

    仪器简介


    JN-2.5C是一款低温超高压连续流细胞破碎机、均质机，利用超高压能量使样品通过狭缝瞬间释放，在剪切效应、空穴效应、碰撞效应的作用下使细胞破碎，使物质均质、分散、乳化、颗粒纳米化。全过程在4–6°C的低温循环水浴中进行，可保持原有物质活性和性能。



    主要功能

    FUNCTION

    1、大肠杆菌、分枝杆菌等细菌破碎；酵母/灵芝孢子等真菌破碎；蓝藻/绿藻等藻类破碎；线虫等细胞破碎；

    2、中草药破碎提取内容物；
    3、酶的制备和分离；重组多肽的制备；
    4、晶体工程；蛋白晶体；
    5、乳剂、脂质体等纳米乳化均质；微乳、纳米混悬剂。



    应用案例

    APPLICATION

    仪器技术支撑性人才


    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。


    教育科研经历

    广州中医药大学   技术支撑性人才

    美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校   访问学者

    华南农业大学生命科学学院    博士


    长期从事细菌脂肪酸及其衍生物合成代谢研究，通过分子遗传学与蛋白质功能研究手段，系统阐明细菌脂肪酸代谢通路关键蛋白的功能研究和致病机制。具备覆盖载体构建、细菌突变株构建与表型验证、蛋白质可溶性表达优化、代谢产物合成优化的分子生物学和合成生物学技术体系。获得省人才国际培养计划1项，参与国家自然科学基金项目和省市级项目4项，发表论文8篇。