广州中医药大学科技创新中心

分类： 蛋白质科学区

  • 平行生物反应器

    平行生物反应器

    仪器简介


    T&J-Minibox Intelli-Ferm(5系列，2.4L*4)平行生物反应器可实现自动控制、数据采集和数据分析。在微生物发酵过程中可实现全自动控制搅拌、温度、PH值、溶氧值、通气量、补料量、消泡剂添加量等；溶氧控制还可实现溶氧+通气+搅拌+补料（串级和交替）式高级自动控制策略；补料控制还可实现按线性方程、指数方程、PH-STAT正向、PH-STAT反向、DO-STAT正向、DO-STAT反向等高级自动控制策略。



    主要功能

    FUNCTION

    1、微生物发酵（细菌、酵母、丝状真菌等）；

    2、小规模蛋白质表达、重组蛋白表达； 
    3、培养基优化、克隆筛选；
    4、发酵工艺开发和工艺优化。



    应用案例

    APPLICATION


    仪器技术支撑性人才


    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。


    教育科研经历

    广州中医药大学   技术支撑性人才

    美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校   访问学者

    华南农业大学生命科学学院    博士


    长期从事细菌脂肪酸及其衍生物合成代谢研究，通过分子遗传学与蛋白质功能研究手段，系统阐明细菌脂肪酸代谢通路关键蛋白的功能研究和致病机制。具备覆盖载体构建、细菌突变株构建与表型验证、蛋白质可溶性表达优化、代谢产物合成优化的分子生物学和合成生物学技术体系。获得省人才国际培养计划1项，参与国家自然科学基金项目和省市级项目4项，发表论文8篇。

  • 蛋白质纯化系统

    蛋白质纯化系统

    仪器简介


    AKTA avant是用于方法探索和纯化工艺优化的自动化制备层析系统，可快速、高质量地快速分离、纯化多种生物分子，如蛋白质、肽类、抗原抗体、寡核苷酸、核苷酸疫苗、病毒、小分子等，适合分离纯化活性物质。UNICORN软件用于控制AKTA avant 的自动化流程，提供直观灵活的方法创建、系统控制和评估，简化纯化任务，提高纯化效率。


    主要功能

    FUNCTION

    1、可联合使用亲和层析、凝胶过滤/尺寸排阻色谱、离子交换层析和疏水层析，对多种生物分子进行数百毫克级的样品分析和制备；

    2、蛋白、多糖的分离与纯化；多聚体的去除；中草药提取物成分分离；
    3、填料筛选和方法优化。



    应用案例

    APPLICATION





    仪器技术支撑性人才


    殷瑜，博士，承担平台蛋白质科学区仪器设备的技术管理与维护，重点负责蛋白质纯化系统、多机型细胞破碎仪的标准化操作与功能开发。


    教育科研经历

    广州中医药大学   技术支撑性人才

    美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校   访问学者

    华南农业大学生命科学学院    博士


    长期从事细菌脂肪酸及其衍生物合成代谢研究，通过分子遗传学与蛋白质功能研究手段，系统阐明细菌脂肪酸代谢通路关键蛋白的功能研究和致病机制。具备覆盖载体构建、细菌突变株构建与表型验证、蛋白质可溶性表达优化、代谢产物合成优化的分子生物学和合成生物学技术体系。获得省人才国际培养计划1项，参与国家自然科学基金项目和省市级项目4项，发表论文8篇。

  • 高性能计算系统（HPC）

    高性能计算系统（HPC）

    仪器简介


    本集群计算节点基于英特尔®至强®可扩展家族处理器平台构建，共包含计算节点46个，每节点配置2颗20核心2.3GHz主频的x86中央处理器，并配合8根3200MT/s DDR4内存条，总双精度峰值计算能力为每秒194.6万亿次。此外，集群配置有完整、高效、专业的基础软件，如Gaussian、AMBER、Gromacs、RStudio Server等，支持CPU和GPU加速卡的多种编译环境及应用。

    使用先进计算平台实现集群监控管理和作业调度功能，实现资源的统一调度与管理，并具有自动计费、余额查询、机时统计等功能。提升集群使用的灵活性和利用效率，为用户提供高速的大规模运算和数据分析能力。


    主要功能

    FUNCTION

    1、生命科学：药物发现和设计；蛋白分子动力学模拟；量子化学计算；深度学习等。

    2、医疗保健：慢病管理与疾病监测；影像辅助诊断；大规模数据集分析和挖掘等。

    3、基因组学：基因组测序及分析；基因功能注释；生物信息学等。

    4、工程设计：工程模拟与优化；人工智能与物理仿真等。

    5、气象环境：天气预报；自然灾害预测；石油勘探等。



    应用案例

    APPLICATION


    基于MD模拟研究配体-蛋白结合模式


     碳谱、ECD计算确定天然产物相对构型、绝对构型


    QM/MM模拟酶催化反应过程能量变化


     

    原发性胆汁性胆管炎患者PBMC单细胞转录组谱

    （doi: 10.1038/s41467-024-53104-9.）


    仪器技术支撑性人才


    龙亮，博士，蛋白科学区计算中心负责人，负责高性能计算集群常规功能的技术指导、新功能的开发以及日常管理和维护等工作。承担本功能区对接研究平台事务性工作任务。


    教育科研经历

    广州中医药大学       技术支撑性人才

    暨南大学/药学院            博士

    中山大学/药学院            硕士

    中国药科大学/药学院      学士


    围绕抗肿瘤药物蛋白靶点的分子动力学性质、抑制剂虚拟筛选及蛋白-配体相互作用机制研究，具备CADD、MD模拟、DFT计算等研究背景。熟练操作AMBER、Gaussian、薛定谔、MOE等计算相关软件。在Nat. Commun.，Sci. Adv.，Eur. J. Med. Chem.等期刊发表SCI论文10余篇，已授权专利 2 项。